MLPA檢測原理

一、MLPA核心原理一句話概括

MLPA通過設計一對特殊的、靶向相鄰DNA序列的探針，只有當這對探針同時與靶序列wanmei結合時，才能連接成一個完整的模板，隨后被通用引物擴增并定量。擴增產物的量直接反映了靶序列的拷貝數。

二、 MLPA檢測原理分步詳解

下面，我們來詳細解讀流程中的每一個關鍵步驟：

 第1步：探針雜交

   一對探針：針對每一個待檢測的靶位點，都設計有兩條非常短的寡核苷酸探針。

       左探針：包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段通用的“引物結合"序列X。

       右探針：包含一段靶序列特異性雜交序列 + 一段長度不等的“填充序列" + 一段通用的“引物結合"序列Y。

   特異性結合：將這一對探針與變性后的樣本DNA混合。它們會尋找并精確地雜交到目標DNA上相鄰的位置（通常只間隔1個核苷酸）。

 第2步：連接反應（最關鍵的一步）

   “連接依賴"的核心：只有當左、右探針都wanmei地與靶DNA結合并緊密相鄰時，連接酶才能將它們共價連接成一條完整的、長的DNA模板。

   嚴苛的質控：如果靶序列缺失（拷貝數為0）或發生點突變導致探針無法結合，連接反應就不會發生。這確保了后續信號的特異性，避免了假陽性。

 第3步：PCR擴增

   通用引物擴增：使用一對針對所有連接產物上通用序列X和Y的引物進行PCR擴增。

   產物長度各異：由于每個右探針的“填充序列"長度不同，因此每個靶位點對應的最終PCR產物都具有獨特的長度（就像不同大小的“條形碼"）。

 第4步：毛細管電泳分離與定量

   按長度分離：將所有PCR產物進行毛細管電泳，嚴格按照片段長度進行分離。

   熒光檢測：PCR引物或探針上標記有熒光基團，因此每個長度的片段會產生一個熒光信號峰。

 第5步：數據分析

   峰高/面積 = 相對拷貝數：通過軟件分析每個峰的高度或面積。將其與同一反應中多個內參基因（已知為二倍體，拷貝數穩定）的峰進行比較。

   結果解讀：

       正常拷貝數（2份）：靶位點峰高與內參峰高比值約為1.0。

       缺失（1份或0份）：比值約為0.5或0。

       重復/擴增（3份或以上）：比值約為1.5或更高。

三、 MLPA原理的獨特優勢

1.  高通量：單次反應可輕松檢測40-50個不同的靶位點。

2.  高特異性與準確性：依賴“雙探針wanmei結合"的連接步驟，如同雙重校驗，極大減少了非特異性擴增。

3.  對DNA質量要求低：因為探針很短（~50-70 nt），即使DNA部分降解（如FFPE樣本），也能有效雜交和連接，而長片段PCR則會失敗。

4.  可檢測甲基化（MS-MLPA）：通過對右探針的雜交序列進行HhaI酶切位點設計。如果靶序列被甲基化，酶切被阻止，探針可連接擴增；如果未甲基化，酶切斷開探針，無法擴增。通過比較酶切處理與未處理的信號，即可判斷甲基化狀態。

四、與其他技術的核心區別

總結來說，MLPA的原理精髓在于其“連接依賴"和“長度編碼"的設計，使其成為檢測已知基因拷貝數變異和甲基化的一種高度多重、精準且經濟高效的技術，特別適用于臨床診斷和大規模篩查。

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